冷藏集裝箱貨物的設定值以及送風和回風的溫度之外，溫度控制系統還以錯誤代碼的形式提供有關系統問題的詳細信息。美國農業部檢測器可以記錄貨物的溫度，該檢測器的安裝符合美國農業部水果運輸的冷藏處理程序。托運人放置在貨物中的數據記錄器也將記錄一般溫度。
根據客戶設備及使用環境要求，還可對特種集裝箱內部進行30-200mm的保溫措施及取暖、制冷設備，滿足環境在高低溫變化時，箱體內部處于恒定溫度，滿足內部設備正常運行，根據保溫效果及防火性能，可以分為A防火及B及阻燃，現在市面大多使用巖棉凈化板、硅鹽凈化板、船艙板等作為內部保溫結構，也有辦公用房屋采用巖棉、玻璃棉、硅鹽等保溫加環保裝飾板制作，由于泡沫板防火等級不足，不建議使用。

用戶選擇冷藏運輸，一般是因為冷藏運輸可以將郵寄的物品一直保持在低溫下，并且完好的運送到目的地。而冷藏運輸之所以可以很快的將物品郵寄到目的地正是因為冷藏運輸有著快速的運輸方式，那么冷藏運輸的方式有哪些?
：裝有冷藏集裝箱的陸上運輸工具據冷藏運輸口碑好的運輸公司而言，冷藏運輸使用較多的運輸工具就是卡車，拖車等交通工具，而通常也會在卡車以及拖車上固定冷藏箱，接著通過發電機來驅動制冷機讓運輸的物品保持低溫，然后通過緩慢安全的運送方式，將運輸物品運送到目的地。
第二：裝有溫控集裝箱的水運交通方式
一般談到水運交通工具，那么使用更多的就是船只，而水上冷藏箱除了在船上裝置溫控集裝箱之外，也會直接使用冷藏船進行水上運輸。而在運輸的過程中，當集裝箱到達碼頭之后就會被轉運到底盤上，然后再經過不斷地處理，就可以安全的將郵寄物品郵寄至目的地。
第三：運用更高運速的空中運輸
一般空運的方式都是使用飛機取進行運輸，而飛機高溫空效果不是特別的強，因此使用飛機去運輸一般都會運輸一些鮮花以及熱帶水果等，因為飛機的速度非常快，所以對于物品的保鮮也有很好的效果。

為了解決集裝箱進出口不平衡的問題，船公司通常要向出口大于進口的地區調撥大量空箱。由于空箱的調撥要增加大量調撥成本，船公司在空箱調撥進口至空箱裝貨出口的過程中更應加強集裝箱管理，避免超期箱的出現。在集裝箱運輸中空箱由進口到出口的整個流程可以歸結如下：
　冷藏集裝箱船舶進港→空箱卸船→碼頭堆存→集裝箱車隊拖箱→空箱進堆場→發貨人提箱→裝箱→重箱進港區→裝船。

冷凍集裝箱工作溫度在-28℃~ 26℃之間，根據貨種的需要，可自動調節是箱內溫度不變。保溫集裝箱適宜裝運對溫濕度敏感的貨物。保溫集裝箱主要用于裝載水果、蔬菜等鮮貨。一般用干冰等冷劑防止箱內溫度過度上升，通常的保溫時間為72小時左右。箱內四周和上下都有充分的防熱構造。